バージョン0.4以降でなければ、UF2経由でのアップデートができません。そのため、DAPLinkを経由してファームウェアを書き換える必要があります。

Using DAPLink Firmware - nRF52840 MDK USB Dongle

今回は、公式に記載されている手順に従い、DAPLinkで接続し、pyocdを使用してファームウェアの書き換えを行いました。

pyocd load -t nrf52840 Downloads\uf2_bootloader-nrf52840_mdk_usb_dongle-0.7.1-s140_6.1.1.hex